1.1997-2007年连续被评定为江苏省一级期刊
 2.1995年被评为江苏省高校优秀自然科学学报
 3.1997年被评为江苏省优秀期刊
 4.1999年被评为江苏省优秀期刊
 5.1999年被评为江苏省高校优秀自然科学学报
 6.2000年获中国学术期刊(光盘版)《CAJ-CD规范》执行优秀奖
 7.2007年被评为江苏省优秀期刊
 8.2007年获江苏省期刊封面设计三等奖
 9.2009年度“数学学科”获“明珠奖”特色栏目奖
 10.2009年度获优秀编辑质量奖
 11.2011年获全国高师学报系统“十佳学报”
 12.2013年荣获全国高师学报系统“高校学科建设贡献奖”
 13.2014年第六届江苏科技期刊“优秀期刊·特色期刊奖”

 14.2016年度中国高校编辑出版质量优秀科技期刊

 15.2016年度“淮海研究”栏目获江苏科技期刊“创意策划奖·十佳品牌栏目奖”

 16.2017年度“淮海研究”栏目获江苏期刊“明珠奖”特色栏目奖

 17.2018，2020年度被中国高校科技期刊研究会评为中国高校优秀科技期刊

 18.2007年至今连续被评为中国科技核心期刊
 19.2020被评为“RCCSE中国核心学术期刊”

 20.2020年度，“甘薯生物学与产业技术”栏目被评为江苏期刊“明珠奖”优秀栏目

 21.2020年度，“甘薯生物学与产业技术”栏目获江苏省科技期刊“金马奖”十佳品牌栏目奖